O Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação (PPGCC) da UFPA foi fundado em 2005 com o curso de Mestrado Acadêmico. O curso de Doutorado passou a ser oferecido no segundo semestre de 2015.

Reconhecido pela CAPES, nos termos da Portaria Nº 84, de 22/12/94, e pelo Ministério da Educação e do Desporto, nos termos da Portaria Nº 694, de 13/06/95, o Programa, na última avaliação da CAPES, relativa ao triênio 2010-2012, obteve a nota 4.

O corpo discente manteve-se ao longo desde período com uma média de 30 alunos a cada ano. A importância do PPGCC para a sociedade foi rapidamente reconhecida por meio do prêmio “Destaque Técnico em Informática”, na categoria Educação, concedido em 2006 pela Sociedade de Usuários de Informática e Telecomunicações do Pará (SUCESU-PA) para valorizar e incentivar o desenvolvimento do setor de tecnologia da informação e comunicação do Estado do Pará.

Apesar de ser um Programa relativamente novo, alcançou conceito 4 na CAPES (avaliação trienal 2010-2012), tendo como diretriz básica ampliar a massa crítica e a produção de pesquisa científica na área, na busca de soluções para problemas regionais, nacionais e globais em prol das ciências e da sociedade. Tal posição deu condições ao PPGCC de ter sua proposta do  Curso de Doutorado em Ciência da Computação na UFPA aprovada, já com a primeira turma iniciando no segundo semestre de 2015.

Em 2022, o programa atingiu um total de 250 defesas de mestrado concluídas. Além disso, O PPGCC foi contemplado com conceito 5 no resultado da avaliação quadrienal da CAPES (2017-2020).

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